基因变异，也叫基因突变，指生物体内的基因序列发生改变，DNA 当中碱基排列顺序出现替换增加或者缺失，造成遗传信息发生变化，是生物界普遍存在的一种生命现象。
基因变异的来源分为两大类，自发变异和诱发变异。自发变异是细胞复制遗传物质的时候自然发生，没有外界干预，属于随机出现的改变。诱发变异来自外部因素影响，紫外线辐射部分化学物质病毒感染，都有可能提高基因变异发生的概率。
很多人会混淆基因变异和遗传病。并不是所有基因变异都会带来疾病。部分变异不会给身体带来明显影响，叫做中性变异。少数变异会给生物带来生存优势，帮助生物更好适应环境。只有一小部分变异，才会引发各类遗传病。生物进化的底层基础，就是一代代积累下来的有利基因变异。
基因变异可以发生在不同细胞当中，带来的结果差别很大。发生在生殖细胞的变异，可以通过生育传递给后代，属于可遗传变异。发生在普通体细胞的变异，只会影响个体自身，不会遗传给下一代。人体部分细胞出现变异，有可能引发细胞异常增殖，但是不代表一定会出现严重病症。
生活当中存在不少认知误区，很多人认为基因变异全部都是不好的变化。实际上变异没有绝对的好坏评判标准，要看所处环境。同样一段基因改变，在某种环境下对身体有利，换到另一种环境，就有可能产生不利影响。变异本身只是遗传信息的改变，不等于患病。
基因变异也不等同于转基因。基因变异是生物自身基因序列发生改变，自然界时时刻刻都在发生。转基因属于人为技术手段，把外来基因导入生物体，二者的发生原理完全不同，不要把两个概念混为一谈。
对于普通人来说，不用过度恐惧基因变异。人体细胞数量庞大，复制过程少量变异很难完全避免。日常减少强辐射有害化学物质接触，能够降低诱发变异的风险，但无法做到完全杜绝变异发生。
学习理解基因变异，能够看懂生物进化遗传疾病相关知识。区分有利中性有害三种变异，分清是否可以遗传，就可以避开网络上很多片面说法，客观看待遗传层面的变化，分辨科学科普和不实传言。